Dua tahun setelah peristiwa Perang Ninja Besar Keempat, bulan yang diciptakan Hagoromo Otsutsuki dahulu kala untuk menyegel Patung Gedo mulai turun ke dunia, mengancam akan menjadi meteor yang akan menghancurkan segalanya saat terkena dampaknya. Di tengah krisis ini, seorang keturunan langsung Kaguya Otsutsuki bernama Toneri Otsutsuki mencoba menculik Hinata Hyuga tetapi akhirnya menculik adik perempuannya, Hanabi. Naruto dan sekutunya sekarang menjalankan misi penyelamatan sebelum menemukan diri mereka terlibat dalam pertempuran terakhir untuk menentukan nasib segalanya.
